2-Abz - 2-Aminobenzoil, solitamente si combina con 2,4-dinitrofenile (Dnp) o 3-nitro-tirosina (NitroTyr) per formare coppie fluoroforo/quencher. eccitazione a 320 nm, emissione a 420 nm.
3-Abz (acido m-amminobenzoico) può essere visto come un -amminoacido. Quando l'acido m-amminobenzoico viene incorporato nelle catene peptidiche, si ottiene una torsione rigida.
4-Abz (acido p-amminobenzoico, PABA), essendo un derivato naturale dell'acido benzoico, può essere utilizzato anche come distanziatore lineare rigido.
Abu, L- -amminobutirrile ((S)-2-amminobutanoile), acido -amminobutirrico, è un derivato di amminoacidi. A causa della sua somiglianza strutturale con gli amminoacidi naturali, viene spesso utilizzato nella progettazione e sintesi di peptidi e mimetici peptidici.
Ac rappresenta l'acetile. L'acetilazione N-terminale è una modifica stabilizzante comune per i peptidi in natura.
Acm, acetamidometile, può essere rimosso utilizzando Hg(II) o Ag(I). È uno dei gruppi protettivi tiolici comunemente usati per la cisteina durante la sintesi di peptidi con più legami disolfuro.
L'ACTH (ormone adrenocorticotropo) è un ormone secreto dall'ipofisi anteriore che stimola la corteccia surrenale a produrre corticosteroidi.
L'Aad (acido L- -aminoadipico) è un amminoacido non proteogenico. La sua struttura è simile all'acido glutammico (Glu), con un gruppo metilenico aggiuntivo nella sua catena laterale.
L'acido (2-amminoetossi)acetico, noto anche come glicina etil estere o glicina etilammide, può essere utilizzato come distanziatore o collegamento nella sintesi di modificazione peptidica.
1-(1'-adamantile)-1-metil-etossicarbonile, un gruppo amminico protettore molto acido-labile nella sintesi peptidica, può essere deprotetto con 3% TFA/CH2Cl2
L'AFC (7-Amino-4-trifluorometilcumarina) è un composto fluorescente con un'eccitazione della cumarina rilasciata a 395-400 nm, emissione a 495-505 nm.
Le specie con peso molecolare più elevato si formano a causa dell'adesione non covalente di specie più piccole. Nelle proteine in particolare, l'aggregazione è una forma di denaturazione che può verificarsi su superfici non polari con strutture secondarie, come quelle che tipicamente formano interazioni intramolecolari e sono sepolte nelle eliche e nei fogli della proteina. Le molecole interagiscono tra loro, talvolta formando forme polimolecolari insolubili. L’aggregazione contrasta con l’oligomerizzazione, la normale interazione delle proteine native correttamente ripiegate per formare polimeri di ordine superiore.
AHX, amminoesanoil,6-acido amminoesanoico, abbreviato anche Aca o LC, tipicamente introdotto come breve distanziatore non polare tra biotina, fluorofori e sequenze peptidiche.
2-L'acido amminoisobutirrico è un raro amminoacido non proteico che è un prodotto finale del metabolismo della pirimidina e viene escreto nelle urine ed è presente in alcuni antibiotici di origine fungina. Utilizzato anche per sostituire gli aminoacidi naturali per la sintesi dei peptidi.
Gli alcoli sono quei composti organici caratterizzati dalla presenza di uno, due o più gruppi idrossilici (−OH) attaccati all'atomo di carbonio in un gruppo alchilico o in una catena idrocarburica. Gli alcoli peptidici sono composti clinicamente cruciali che non sono sufficientemente studiati negli studi sulla relazione struttura-attività (SAR) per la scoperta di farmaci. Ad esempio, DAMGO è un agonista del recettore oppioide modificato dall'alcol al C-terminale, con la sequenza di Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Ha elevata selettività e affinità per il recettore μ-oppioide.
Un'aldeide è un composto organico in cui il gruppo carbonilico è attaccato a un atomo di carbonio all'estremità di una catena di carbonio. Le aldeidi peptidiche sono strumenti importanti in biochimica e biologia chimica per l'inibizione e la disabilitazione chimica delle proteasi.
Aloc - Allilossicarbonile, gruppo amminico protettivo (anche abbreviato Alloc). La protezione può essere rimossa con Pd(PPh3)4.
La malattia di Alzheimer, caratterizzata da placche di amiloide e grovigli di tau, deriva da disfunzione sinaptica e problemi del percorso di eliminazione, che causano deterioramento cognitivo.
L'7-amino-4-metilcumarina (AMC) è una sonda fluorescente comune per la marcatura dei peptidi negli studi sulla proteasi. La sua coniugazione con un peptide spegne il segnale fluorescente e l'AMC rilasciato in seguito alla scissione della proteasi può quantificare l'attività enzimatica, con massimi di eccitazione/emissione di 345/445 nm. Ad esempio, il peptide fluorescente substrato preferito per determinare l'attività simile alla tripsina del proteasoma purificato, con la sequenza: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.
Peptide natriuretico atriale (ANP), un ormone prodotto e rilasciato dagli atri del cuore in risposta all'aumento del volume e della pressione del sangue. Funziona per regolare l'equilibrio dei liquidi e la pressione sanguigna promuovendo la vasodilatazione, aumentando la produzione di urina (diuresi) e riducendo il riassorbimento di sodio nei reni. Queste azioni aiutano a contrastare gli effetti dell’ipertensione e del sovraccarico di liquidi nel corpo.
I peptidi antigenici sono brevi sequenze di aminoacidi derivate da proteine o altre biomolecole che attivano la risposta immunitaria di un organismo. Questi peptidi sono riconosciuti dal sistema immunitario come estranei o estranei al corpo, portando all'attivazione di cellule immunitarie come le cellule T e le cellule B. I peptidi antigenici svolgono un ruolo cruciale nelle risposte immunitarie, compresa la produzione di anticorpi adattativi e lo sviluppo della memoria immunitaria. Sono ampiamente studiati in immunologia e nello sviluppo di vaccini a causa del loro potenziale di innescare risposte immunitarie specifiche contro agenti patogeni o cellule anormali.
Peptide ramificato asimmetrico
La sintesi di peptidi asimmetrici con 2, 4 e 8 rami può essere ottenuta inserendo strategicamente lisina, arginina o acido glutammico nella sequenza peptidica.
Dimetilarginina asimmetrica (ADMA)
La dimetilarginina asimmetrica (ADMA, Arg(Me)2) è un composto chimico presente in natura e un inibitore endogeno dell'ossido nitrico sintasi (NOS). Fmoc-Arg(Me)2-OH (asimmetrico) può essere utilizzato direttamente per la sintesi di peptidi contenenti dimetilarginina asimmetrica.
5-L'acido aminovalerico può essere utilizzato come distanziatore o collegamento nella sintesi della modificazione peptidica.
Il benzilossimetile (Bom) è un gruppo protettivo imidazolico acido-labile utilizzato nel processo Boc-SPPS per peptidi contenenti istidina. Il benzilossimetile produce formaldeide altamente reattiva dopo il trattamento con acido. Pertanto, Bom è il migliore scisso in presenza di Cys, metossiammina o altri composti che reagiscono con le aldeidi.
Gli amminoacidi hanno il loro gruppo amminico attaccato al carbonio, che è il secondo atomo di carbonio lontano dal gruppo carbossilico. La formula strutturale generale di un -amminoacido può essere rappresentata come: R−CH(NH2)−COOH
Peptide natriuretico di tipo B (BNP), un ormone prodotto principalmente dai ventricoli del cuore in risposta all'eccessivo stiramento delle cellule del muscolo cardiaco. Svolge un ruolo cruciale nella regolazione della pressione sanguigna e dell’equilibrio dei liquidi, principalmente promuovendo la vasodilatazione e aumentando l’escrezione di sodio attraverso i reni.
Il t-butilossicarbonile (Boc) è un gruppo protettivo molto acido-labilea-amminico nella sintesi peptidica, può essere scisso da TFA/cloruro di metilene (1:1), HCl in acetato di etile o diossano, acido formico al 98%.
2-(4-Bifenilil)isopropilossicarbonile (Bpoc) è un gruppo protettivo molto acido-labilea-amminico nella sintesi peptidica, può essere scisso con 1% TFA/cloruro di metilene.
Peptidi con 2, 4 e 8 rami possono essere ottenuti inserendo strategicamente lisina, arginina o acido glutammico nella sequenza peptidica.
t-Butyldimethylsilil (TBS o TBDMS) è un gruppo protettivo idrossilico compatibile con Fmoc-SPPS. È acido-labile e può essere scisso selettivamente dagli ioni fluoruro.
Il benzoile è un gruppo acilico spesso introdotto all'N-terminale dei peptidi. È meno polare dell'acetile (Ac) e può essere una modifica permanente.
Benzile (Bzl) un residuo alchilico e un gruppo protettivo della catena laterale utilizzato per bloccare gli alcoli (Ser, Thr, Hyp) nella sintesi peptidica. può essere scisso mediante acidi forti o idrogenolisi catalitica (ad esempio idrogeno/Pd).
La colecistochinina (CCK) è un ormone peptidico prodotto dalla mucosa dell'intestino superiore e presente nel sistema nervoso centrale. Stimola la contrazione della cistifellea, il rilascio di enzimi pancreatici e influenza vari processi gastrointestinali.
Il peptide correlato al gene della calcitonina (CGRP) è un 37-peptide di aminoacidi correlato a calcitonina, amilina e adrenomedullina. Esiste in due forme, -CGRP (CGRP I) e -CGRP (CGRP II), con attività biologiche simili. Il CGRP si trova principalmente nei neuroni sensoriali e centrali, influenzando la funzione cardiovascolare, il metabolismo del calcio e il tono vascolare fetoplacentare. I suoi recettori sono accoppiati alle proteine G e attivano l'adenilato ciclasi, interagendo con le proteine che modificano l'attività dei recettori (RAMP) per la specificità del ligando e il traffico cellulare.
La L-cicloesilalanina (Cha) è un amminoacido non polare analogo della fenilalanina, dove l'anello aromatico è sostituito da un anello cicloesano. Questa sostituzione consente di studiare il ruolo degli amminoacidi aromatici in interazioni come le interazioni π-π sostituendo i residui di fenilalanina con Cha negli esperimenti.
La L- -cicloesilglicina (Chg) è un amminoacido non polare stericamente impedito. Serve come importante intermedio farmaceutico e si trova anche nei prodotti naturali.
Il colesterolo è prodotto naturalmente dal fegato e da altre cellule del corpo, ma può anche provenire dal cibo che mangiamo, in particolare da prodotti animali come carne, pollame e latticini grassi. Il colesterolo può essere collegato ai peptidi per migliorare la farmacocinetica.
cis-idrossiprolina, lo stereoisomero della trans-idrossiprolina naturale.
La citrullina è presente nelle proteine come risultato di una modifica enzimatica post-traduzionale dei residui di arginina.
CMK è un inibitore della chinasi RSK2 con potenza simile ma minore stabilità chimica rispetto a FMK.
Il peptide natriuretico di tipo C (CNP) è un peptide delle cellule endoteliali vascolari, noto per i suoi effetti vasodilatatori. Presenta somiglianze strutturali e fisiologiche con i peptidi natriuretici atriali e cerebrali (ANP e BNP).
L- -Ciclopentilglicile (Cpg), è un amminoacido non polare stericamente impedito.
Nella sequenza peptidica, quell'unico residuo che è collegato alla sequenza lineare tramite il suo gruppo amminico, lasciandola con un gruppo carbossilico libero. Il gruppo carbossilico di questo residuo può subire modifiche come l'ammidazione o, in casi come il piroglutammato, la lattamizzazione interna.
La cianina 3 è un colorante cianinico rosso-fluorescente comunemente eccitato da una sorgente luminosa intorno a 558 nm ed emette luce a circa 572 nm.
La cianina 5 è un fluoroforo colorante cianinico che emette una fluorescenza nel vicino infrarosso comunemente eccitata da una sorgente luminosa intorno a 646 nm ed emette luce a circa 664 nm.
L'acido L-, -diamminobutirrico è un acido ,ω-diammino, un analogo più breve dell'ornitina (Orn) e della lisina (Lys). Con un'adeguata protezione, gli ,ω-diamminoacidi possono essere modificati selettivamente nella loro posizione Nω o incorporati per creare peptidi ramificati o dendrimeri.
L'acido 3-(dimetilamminoazo)benzene-4-carbossilico è un cromoforo legato a gruppi amminici utilizzato in applicazioni di biochimica e biologia molecolare come quencher nel trasferimento di energia per risonanza di fluorescenza (FRET), ad esempio con EDANS. Eccitazione di DABCYL a 454 nm.
Dabsyl,4-dimetilamminobenzenesulfonil cloruro, un cromoforo legato a gruppi amminici utilizzato come quencher in combinazione, ad esempio con EDANS. Eccitazione di Dabsyl a 436 nm.
4-Dimetilammino-1-naftalene-solfonile, un fluoroforo legato a gruppi amminici, eccitazione a 342 nm, emissione a 562 nm.
L'acido L-, -diamminopropionico (Dap o Dpr) è un acido ,ω-diammino, che è un analogo più breve dell'acido diamminobutirrico (Dab), dell'ornitina (Orn) e della lisina (Lys). I derivati modificati degli ,ω-diamminoacidi possono essere alterati selettivamente nella loro posizione Nω o incorporati per creare peptidi ramificati o dendrimeri.
1-(4,4-Dimetil-2,6-diossocicloesone-1-ilidene)etile (Dde) è un gruppo amminoprotettivo utilizzato nella sintesi peptidica. Può essere scisso selettivamente utilizzando il 2% di idrazina idrato in dimetilformammide (DMF). Nω-Dde consente la rimozione specifica di Dde da amminoacidi come Dap, Dab, Orn o Lys dopo la sintesi peptidica in fase solida Fmoc (SPPS), facilitando la modifica sulla resina del gruppo Nω-amminico.
I legami disolfuro sono legami covalenti formati tra due gruppi sulfidrilici (-SH) di residui di cisteina nelle proteine.
Il 2,4-dimetossibenzile è un gruppo protettivo della formammide acido-labile utilizzato per la modifica reversibile della struttura principale nella sintesi peptidica. Vengono incorporati durante la sintesi peptidica in fase solida (SPPS) come amminoacido o dipeptide Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), dove Fmoc previene l'aggregazione peptidica e quindi promuove un allungamento efficiente. Dmb promuove anche le reazioni di ciclizzazione e previene la formazione di asparagimide. A differenza dei derivati dell'Hmb, il Dmb non forma benzoxazepine durante l'attivazione.
2,4-Il dinitrofenile è un cromoforo coniugato a gruppi amminici, comunemente utilizzato come quencher nei substrati FRET (fluorescenza per risonanza energetica).
Il 4,4′-dimetossiditile, noto anche come bis-(4-metossifenil)metil, è un gruppo protettivo carbossammide acido-labile compatibile con la sintesi peptidica in fase solida Fmoc (SPPS).
La DOPA, 3,4-diidrossifenilalanina, è un precursore di diversi neurotrasmettitori cruciali, tra cui dopamina, norepinefrina ed epinefrina.
L'acido (4,7,10-tricarbossimetil-1,4,7,10-tetraazaciclododecil)-acetico, abbreviato come DOTA, è un chelante ciclico tipicamente attaccato all'N-terminale dei peptidi. DOTA facilita la marcatura di peptidi con radionuclidi come 68Ga o 90Y per varie applicazioni biomediche, tra cui l'imaging e la terapia mirata.
Difenilmetil (ditile), un gruppo protettivo N-, O- e S labile agli acidi.
L'acido dietilenetriaminopentaacetico (DTPA) è un utile agente chelante per radionuclidi come (68)Ga, (99m)Tc e (111)In, applicabili all'imaging di medicina nucleare.
L'acido 5-[(2-Aminoetil)ammino]naftalene-1-solfonico (EDANS) è un fluoroforo comunemente legato all'Nω dei diamminoacidi come la lisina. Viene spesso utilizzato nei substrati FRET, tipicamente abbinato a quencher come DABCYL. EDANS ha una lunghezza d'onda di eccitazione di 340 nm ed emette a 490 nm.
Polipeptide attivante i monociti endoteliali.
L'etile, un gruppo alchilico e omologo del metile (Me), viene utilizzato per modifiche permanenti di N- e S-etilazione nei peptidi.
La mappatura degli epitopi (mappatura degli epitopi antigenici) è una tecnica utilizzata per determinare le aree specifiche (ovvero gli epitopi antigenici) su un antigene che può essere riconosciuto dagli anticorpi o dal sistema immunitario. Gli epitopi dell'antigene possono essere suddivisi in epitopi lineari ed epitopi conformazionali. Attraverso la mappatura degli epitopi antigenici, possiamo comprendere a fondo la relazione tra la struttura e la funzione dell'antigene, che è di grande importanza nello sviluppo di vaccini, nella diagnosi delle malattie, nell'immunoterapia e in altri aspetti.
Alcuni metodi di mappatura degli epitopi antigenici comunemente usati includono:
Cristallografia a raggi X: può analizzare direttamente la struttura tridimensionale dell'antigene, determinando così la posizione dell'epitopo.
Risonanza magnetica nucleare: può anche essere utilizzata per analizzare la struttura dell'antigene per determinare l'epitopo.
Tecnica di scansione del peptide: utilizzo di una serie di segmenti peptidici sintetici sovrapposti per identificare l'epitopo che si lega all'anticorpo.
Ad esempio, nella ricerca e nello sviluppo di vaccini, chiarire gli epitopi chiave dell’antigene aiuta a progettare vaccini più efficaci e a indurre una risposta immunitaria più mirata; nella diagnosi delle malattie, la determinazione degli epitopi antigenici correlati a malattie specifiche può sviluppare reagenti diagnostici più accurati.
5-FAM (5-Carbossifluoresceina) è un fluoroforo comunemente utilizzato per la marcatura di biomolecole, con una lunghezza d'onda di eccitazione di 490 nm ed emissione a 520 nm.
La fluoresceina-6-carbonile è un fluoroforo legato a gruppi amminici, con una lunghezza d'onda di eccitazione di 490 nm ed emissione a 520 nm.
L'isotiocianato di fluoresceina (FITC) è un fluoroforo che reagisce con i gruppi amminici. Quando si etichetta un peptide al suo N-terminale con FITC, viene comunemente inserito uno spaziatore come -alanina o Ahx. FITC ha una lunghezza d'onda di eccitazione di 490 nm e di emissione a 520 nm.
9-Il fluororenilmetile è un gruppo protettivo base-labile utilizzato per la protezione O e S.
FMK, fluorometil chetone, è un inibitore irreversibile della chinasi RSK2.
9-Il fluoronilmetossicarbonile (Fmoc), il gruppo amminico protettivo nella sintesi in fase solida FMOC, può essere rimosso con piperidina/DMF al 20%.
Formyl è un gruppo protettivo dell'indolo utilizzato in Boc-SPPS. Trp(For) viene scisso dall'HF in presenza di un mercaptano o da basi come la piperidina.
Il trasferimento di energia per risonanza di fluorescenza (FRET) è il trasferimento di energia non radiativa da un fluoroforo eccitato (donatore) a un accettore adatto (quencher). Il trasferimento dipende dalla distanza, dall'orientamento del dipolo e dalla sovrapposizione spettrale del donatore e dell'accettore. Nei substrati FRET, il fluoroforo e il quencher sono collegati tramite una catena peptidica. La scissione enzimatica aumenta la fluorescenza separando il donatore e l'accettore.
La fluorescenza è la luce emessa da una sostanza che assorbe luce o altre radiazioni elettromagnetiche. Ciò si verifica quando le molecole chiamate fluorofori assorbono fotoni di una lunghezza d'onda specifica, si eccitano, quindi emettono fotoni e ritornano al loro stato fondamentale. La luce emessa ha tipicamente una lunghezza d'onda maggiore e un'energia inferiore rispetto alla luce assorbita, risultando in uno spettro di fluorescenza caratteristico. Questo fenomeno è ampiamente utilizzato per una varietà di scopi scientifici e medici, tra cui la microscopia, la citometria a flusso e la spettroscopia di fluorescenza.
Il polipeptide inibitorio gastrico (GIP), noto anche come peptide insulinotropico glucosio-dipendente, appartiene alla famiglia degli ormoni delle secretine. Stimola la secrezione di insulina, inibisce la secrezione di acido gastrico e svolge un ruolo cruciale nella regolazione della secrezione di insulina e dell'omeostasi del glucosio.
L'- -acido carbossiglutammico (Gla) si forma attraverso la carbossilazione post-traduzionale dell'acido glutammico, dando origine a proteine capaci di legare gli ioni calcio, come l'osteocalcina. I peptidi contenenti Gla sono idealmente sintetizzati utilizzando la sintesi peptidica in fase solida Fmoc (SPPS), poiché il Gla può subire decarbossilazione per produrre acido glutammico in presenza di acidi forti.
I peptidi simili al glucagone sono membri della superfamiglia del glucagone di ormoni peptidici derivati dalla regione C-terminale del proglucagone. Sono sintetizzati principalmente dalle cellule L intestinali.
L'ormone di rilascio della gonadotropina (LHRH) è un ormone decapeptide prodotto nelle cellule neurosecretorie ipotalamiche e rilasciato in impulsi pulsati nella circolazione portale ipofisaria. La secrezione pulsante è fondamentale per le funzioni riproduttive, lo sviluppo sessuale e la differenziazione.
L'ormone di rilascio dell'ormone della crescita (GHRH), noto anche come somatorelina, è un ormone peptidico ipotalamico che stimola la ghiandola pituitaria a rilasciare e sintetizzare l'ormone della crescita.
L'ormone di rilascio dell'ormone della crescita (GHRH), noto anche come somatorelina, è un ormone peptidico ipotalamico che stimola la ghiandola pituitaria a rilasciare e sintetizzare l'ormone della crescita.
L'antigene leucocitario umano (HLA) si riferisce a un gruppo di proteine presenti sulla superficie delle cellule che svolgono un ruolo cruciale nel riconoscimento delle sostanze estranee da parte del sistema immunitario. Sono codificati dai geni del complesso maggiore di istocompatibilità (MHC) negli esseri umani e sono essenziali per la presentazione degli antigeni alle cellule T, consentendo al sistema immunitario di distinguere tra cellule self e non self. Le molecole HLA sono altamente diverse e polimorfiche e contribuiscono in modo significativo alle risposte immunitarie individuali e alla suscettibilità alle malattie autoimmuni e al rigetto dei trapianti.
2-idrossi-4-metossibenzile è un gruppo protettivo della formammide acido-labile utilizzato per la modifica reversibile della struttura principale nella sintesi peptidica. Viene incorporato come amminoacido o dipeptide Fmoc-Hmb (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) durante la sintesi del peptide Fmoc in fase solida (SPPS), prevenendo l'aggregazione e consentendo un'efficiente estensione del peptide. L'Hmb aiuta anche nelle reazioni di ciclizzazione e previene la formazione di asparagina.
La L-omoarginina è un omologo della L-arginina, abbreviato in Har, e può essere trovata nel plasma e nelle urine. L'omoarginina è il risultato della guanidinazione della lisina, che può essere effettuata anche su peptidi e proteine.
L'omocitrullina è un omologo della L-citrullina, abbreviato in Hci, e può essere rilevato nell'urina umana.
La L-omocisteina è un omologo della cisteina, abbreviata in Hcy, ed è prodotta dalla demetilazione della metionina. Livelli elevati di Hcy nel sangue sono un fattore di rischio per malattie cardiovascolari e neurodegenerative. A differenza dei derivati della Cys, i derivati dell'Hcy non racemizzano durante l'accoppiamento, né lo fa l'α-elimina.
Omologhi della L-leucina, abbreviati in Hle.
L'omofenilalanina, omologo della fenilalanina, abbreviato in Hph, è un componente degli ACE e degli inibitori della renina. Fmoc-Homophe-OH è un potenziale farmaco antinfiammatorio.
L-omoprolina o acido L-picolico, abbreviato in Pip o Hpr. L'omologo della prolina Hpr è un prodotto di degradazione della L-lisina. Entrambi gli enantiomeri possono essere rilevati nel plasma umano. Poiché i residui di prolina influenzano fortemente la conformazione del peptide, la sostituzione di Pro con Hpr (o azetidina-2-acido carbossilico (Aze)) può modulare la sua struttura secondaria.
La L-transidrossiprolina viene prodotta post-traduzionalmente dall'ossidazione della prolina. L'Hyp è un componente importante del collagene e delle proteine dei mitili.
L'isoserina, un isomero della L-serina, è un amminoacido.
ivDde, un gruppo amminico protettore, può essere deprotetto e scisso dal 2% di idrazina idrata in DMF. ivDde è più stabile del Dde nel frequentare più trattamenti con piperidina durante Fmoc-SPPS. Nω-ivDde può essere rimosso selettivamente da Dap, Dab Orn o Lys, consentendo la modifica post-sintetica su resina del gruppo Nω-amminico.
L'emocianina della patella del buco della serratura (KLH) è una grande metalloproteina multisubunità che trasporta ossigeno presente nell'emolinfa dell'emocianina della patella del buco della serratura gigante. Come trasportatore di antigene, KLH solitamente migliora l'immunogenicità e le capacità di fissaggio dell'antigene accoppiando sequenze polipeptidiche bersaglio, promuovendo in modo significativo la generazione di anticorpi efficienti, specifici e funzionali.
L'ormone di rilascio dell'ormone luteinizzante (LHRH o GnRH) è un ormone decapeptide sintetizzato dalle cellule neurosecretrici all'interno dell'ipotalamo e rilasciato in modo pulsante nella circolazione portale dell'ipofisi. La secrezione pulsante è fondamentale per la funzione riproduttiva, lo sviluppo sessuale e la differenziazione.
Nella progettazione e sintesi dei peptidi, i ricercatori possono inserire un collegamento tra la biotina o la fluorescenza e i peptidi. Un distanziatore idrofobo comune è l'acido amminoesanoico (Ahx) e un distanziatore idrofilo comune è il poli(etilene) glicole (PEG).
Processo di liofilizzazione, che rimuove il liquido dai materiali sensibili al calore. Il materiale viene congelato, posto sotto vuoto spinto e mantenuto a basse temperature. La pressione creata dal vuoto fa sì che il ghiaccio passi dallo stato solido a quello gassoso senza passare attraverso lo stato liquido. I peptidi vengono solitamente forniti come polvere liofilizzata.
La cromatografia liquida-spettrometria di massa è una tecnica analitica versatile che integra la cromatografia liquida con la spettrometria di massa per fornire informazioni dettagliate sulla composizione e la struttura delle molecole all'interno di campioni complessi.
Peptidi antigenici multipli. Il Multiple Antigenic Peptide è un metodo potente per produrre anticorpi anti-peptidi ad alto titolo e vaccini peptidici sintetici.
La spettrometria di massa con desorbimento/ionizzazione laser assistita da matrice (MALDI-MS) è una tecnica analitica utilizzata per misurare il rapporto massa/carica degli ioni. È particolarmente utile per l'analisi di biomolecole come peptidi, proteine e polimeri.
La spettrometria di massa (MS) è una potente tecnica analitica utilizzata per misurare il rapporto massa/carica (m/z) degli ioni.
La 4-metossi- -naftilamide, abbreviato in MNA, è un fluoroforo solitamente attaccato a un substrato di carbossipeptidasi all'estremità C. 4M NA scisso si eccita a 335-350 nm ed emette a 410-440 nm
Il metossibenzenesulfonile (Mbs) è un gruppo protettivo guanidilico utilizzato nella sintesi peptidica in fase solida basata su Boc (Boc-SPPS). Questo gruppo protettivo può essere deprotetto mediante scissione con acido fluoridrico (HF).
4-Il metilbenzile (Mbzl) è un gruppo protettivo sulfidrilico utilizzato nella sintesi peptidica in fase solida basata su Boc (Boc-SPPS). Mbzl è più stabile del metossibenzile (Mob) sotto frequenti trattamenti con acido trifluoroacetico (TFA) e può essere rimosso mediante scissione del fluoruro di idrogeno (HF).
L'acido (7-metossicumarina-4-il)acetico (Mca) è un fluoroforo che può essere collegato a un gruppo amminico.
La Mca si lega al dinitrofenile (Dnp) per i substrati di trasferimento di energia per risonanza di fluorescenza (FRET). La lunghezza d'onda di eccitazione è 325 nm e la lunghezza d'onda di emissione è 392 nm.
L'ormone concentratore di melanina (MCH) è un neuropeptide ciclico isolato per la prima volta da pesci e ratti. L'MCH è principalmente coinvolto nella regolazione della pigmentazione della pelle nei pesci teleostei e nel comportamento alimentare nei mammiferi.
Il metile, il sostituente alchilico più semplice, è coinvolto nella N-, O- e S-metilazione, che costituiscono modifiche permanenti del peptide.
3-Il metossisuccinile, corrispondente all'Asp(OMe) deaminato, è un gruppo bloccante N-terminale polare comunemente incorporato nei substrati della carbossipeptidasi.
La metilazione è una modifica post-traduzionale (PTM) di peptidi e proteine in cui un gruppo metilico (-CH3) viene aggiunto enzimaticamente a specifici residui aminoacidici, comunemente lisina (Lys), arginina (Arg), istidina (His) o glutammato ( Glu). Questa modifica può influenzare in modo significativo la funzione delle proteine, la stabilità e le interazioni con altre molecole, svolgendo così un ruolo fondamentale nella regolazione di diversi processi cellulari tra cui l'espressione genica, la trasduzione del segnale e le interazioni proteina-proteina.
Il complesso maggiore di istocompatibilità (MHC) è una regione genetica contenente geni che codificano per molecole MHC. Queste molecole svolgono un ruolo cruciale nel sistema immunitario e nell’autoimmunità. Negli esseri umani, questo complesso è noto anche come sistema dell’antigene leucocitario umano (HLA).
Le molecole MHC di classe I (MHC I) sono proteine sulla superficie cellulare che presentano peptidi dall'interno della cellula alle cellule T citotossiche. Ciò aiuta le cellule immunitarie a riconoscere e distruggere le cellule infette o anormali, cruciali per la difesa immunitaria contro agenti patogeni e cancro.
Le molecole MHC di classe II (MHC II) sono proteine della superficie cellulare che presentano peptidi derivati da sostanze estranee alle cellule T helper. Questa interazione è essenziale per coordinare le risposte immunitarie e attivare altre cellule immunitarie contro gli agenti patogeni.
L'arginina monometilata (MMA) è una modificazione post-traduzionale in cui un singolo gruppo metilico (-CH3) viene aggiunto enzimaticamente all'azoto guanidinico di un residuo di arginina all'interno di un peptide o di una proteina
La 3-mercaptopropilammina può essere utilizzata come ligando o modificatore peptidico in varie applicazioni biochimiche e biomediche.
La miristoilazione è un processo di modificazione dei lipidi in cui un gruppo miristoilico, costituito da un acido grasso saturo di carbonio 14-, è legato covalentemente all'N-terminale del peptide. Questa modifica serve ad ancorare la proteina alla membrana cellulare, facilitandone la localizzazione e la partecipazione a diversi processi cellulari.
-(1-naftil)-L-alanina è un derivato amminoacidico non polare simile alla fenilalanina, ma con un gruppo naftile invece di un gruppo fenile.
-(2-Naftil)alanina è un derivato amminoacidico non polare simile alla fenilalanina, ma con un gruppo naftile invece di un gruppo fenile.
3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-diazolo (NBD) viene solitamente introdotto coniugando il reagente NBD-Cl al peptide. I peptidi marcati con NBD sono ampiamente scelti per la loro utilità negli studi incentrati sulle membrane e sulla biologia cellulare.
La N-etilammide può essere considerata una forma decarbossilata dell'alanina C-terminale. Nell'agonista dell'LHRH buserelin, NHEt funge da analogo della glicinamide C-terminale. Il peptide N-etilamide è resistente alla degradazione da parte delle carbossipeptidasi.
La L-norleucina (Nle) è un isostere stabile della L-metionina. Quando l'attività biologica di un peptide è compromessa a causa della formazione di solfossido, Nle può essere sostituito da Met senza alterarne il comportamento funzionale.
NOTA, 1,4,7-triazaciclononano-1,4,7-acido triacetico, è un chelante bifunzionale che funge da struttura per la costruzione di strumenti di imaging PET. Viene utilizzato anche nella progettazione di sonde e nell'amplificazione del segnale attraverso effetti multivalenti e contiene potenziali applicazioni come radiofarmaco diagnostico al gallio.
N-Me di solito si riferisce alla N-metilazione, una modifica chimica in cui un gruppo metilico (-CH 3 ) è attaccato a un atomo di azoto nella molecola, come N-Me-Gly, N-Me-Ser, N -Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val , N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, ecc.
NODAGA,1,4,7-triazaciclononano,1-acido glutarico-4,7-acido diacetico, è un eccezionale chelante bifunzionale per la progettazione e lo sviluppo di radiofarmaci organometallici, offrendo significativi potenziale per applicazioni nell’imaging diagnostico e nella radioterapia mirata.
2-Il nitrofeniltio (Nps) è un gruppo protettivo S utilizzato nella sintesi peptidica in fase solida basata su Boc (Boc-SPPS). Può essere scisso dai tioli, in particolare attraverso il gruppo solfidrilico libero della cisteina (Cys), portando alla simultanea formazione di un legame disolfuro.
Il neuropeptide Y (NPY) è un importante neuropeptide nel cervello e fa parte della famiglia dei neuropeptidi Y, che comprende il polipeptide pancreatico (PP) e il peptide YY (PYY).
2-Nitro-2-piridilsulfenile (Npys) è un gruppo protettivo S compatibile con la sintesi peptidica in fase solida basata su Boc (Boc-SPPS). Npys può essere scisso dai tioli, in particolare attraverso il gruppo solfidrilico libero della cisteina (Cys), determinando la formazione simultanea di un legame disolfuro.
La norvalina è un amminoacido alifatico non polare e un omologo dell'acido -aminobutirrico (Abu).
-La naftilamide è un fluoroforo comunemente usato nei substrati della carbossipeptidasi, tipicamente legato al C-terminale dei peptidi. L'NA scissa si eccita a 330 nm ed emette a 370 nm.
-La naftilamide è un fluoroforo comunemente usato nei substrati della carbossipeptidasi, tipicamente legato al C-terminale dei peptidi. Scissione NA a 320-340 nm, emissione a 410-420 nm.
L'estere allilico è un gruppo protettivo carbossilico compatibile con la sintesi peptidica in fase solida (SPPS) basata sia su Fmoc che su Boc. Similmente all'Aloc, gli esteri allilici possono essere rimossi selettivamente mediante trattamento con Pd(PPh3)4. In Fmoc-SPPS, Asp(OAll) è suscettibile alla formazione di aspartimide catalizzata da basi.
L'estere benzilico, un gruppo protettivo carbossilico, può essere rimosso mediante idrogenazione catalitica (ad esempio H2/Pd) o acidi forti.
OcHex è il gruppo protettivo carbossilico standard utilizzato nella sintesi peptidica in fase solida basata su Boc (Boc-SPPS).
4-(N-[1(4,4-Dimetil-2,6-diossocicloesilidene)-3-etilbutil]ammino)benzil estere (ODmab) è un carbossile che protegge gruppo utilizzato nella sintesi peptidica in fase solida basata su Fmoc (Fmoc-SPPS). Può essere tagliato e deprotetto utilizzando idrazina idrata al 2% in DMF.
L'estere 2,4-dimetossibenzilico è un gruppo protettivo carbossilico altamente labile agli acidi che può essere rimosso utilizzando TFA all'1% in diclorometano.
Estere etilico, a causa delle rigorose condizioni richieste per la rimozione degli esteri etilici, la modifica dei peptidi con esteri etilici può migliorare la loro lipofilicità e stabilità.
9-L'estere fluorenilmetilico è un gruppo protettivo carbossilico base-labile che può essere rimosso utilizzando la piperidina nel DMF.
Esteri esilici, a causa delle rigorose condizioni richieste per la rimozione degli esteri etilici, la modifica dei peptidi con esteri etilici può migliorare la loro lipofilicità e stabilità.
L'acido L-Otaidroindolo-2-carbossilico (Oic) è un amminoacido impedito non polare. L'inserimento di questo amminoacido correlato alla prolina nella sequenza polipeptidica influenza fortemente la conformazione del peptide.
Gli esteri metilici sono gruppi protettivi C-terminali semipermanenti nella sintesi in fase liquida e possono essere convertiti in idrazidi peptidiche, precursori di azidi peptidiche reattive. L'accoppiamento dell'azide rimane il metodo di accoppiamento dei frammenti più popolare nella sintesi peptidica in fase liquida.
L'estere 3-metilpent-3-il (OMpe) è un gruppo protettivo carbossilico acido-labile spesso impiegato per proteggere il gruppo carbossilico dell'acido aspartico (Asp) nella sintesi peptidica in fase solida basata su Fmoc (Fmoc-SPPS ).Questo analogo dell'estere terz-butilico più impegnativo dal punto di vista sterico è stato sviluppato specificamente per ridurre la formazione di asparagimide catalizzata da basi.
Gli esteri orto-nitrofenilici degli amminoacidi Boc o Z sono derivati preattivati utilizzati nella sintesi di soluzioni peptidiche.
L'ornitina (Orn) viene prodotta dall'arginina durante il ciclo dell'urea e può essere osservata anche nei peptidi come prodotto di degradazione dell'arginina. La formazione di orni tramite acilazione della porzione guanidinica dell'arginina è una reazione collaterale comune nella sintesi peptidica.
L'estere idrossisuccinimmide (OSu, abbreviato come NHS) è un derivato amminoacidico preattivato comunemente utilizzato nella sintesi peptidica, in particolare nella modifica peptidica. Gli esteri OSu sono sicuri, non sterici, compatibili con i sistemi acquosi e facili da maneggiare.
Terz-butile estere, un gruppo protettivo carbossilico acido-labile per gli amminoacidi nella sintesi peptidica.
4-acido amminobenzoico (acido para-amminobenzoico), può essere utilizzato per la sintesi di linker coniugati anticorpo-farmaco. Ad esempio, Mal-PEG2-Val-Cit-PABA è un linker anticorpo farmaco-coniugato (ADC) scindibile.
Il PABC (para-amminobenzil carbammato) è un composto chimico utilizzato nella sintesi di coniugati farmaco-anticorpo (ADC) come linker. Facilita l’attacco dei farmaci agli anticorpi in modo controllato, consentendo la somministrazione mirata di farmaci nelle terapie antitumorali e in altre applicazioni biomediche. Ad esempio, Mc-Val-Cit-PABC-PNP è un linker scindibile con catepsina utilizzato nei coniugati anticorpo-farmaco (ADC).
Il polipeptide attivante l'adenilato ciclasi dell'ipofisi (PACAP) è un neuropeptide altamente conservato espresso in modo prominente in tutto il cervello dei mammiferi. Esercita i suoi effetti biologici migliorando i livelli di AMP ciclico intracellulare attraverso l'interazione dei recettori.
Palmitoile, un gruppo acilico non polare introdotto all'estremità N-terminale o laterale. La palmitoilazione è stata osservata anche come modificazione post-traduzionale delle proteine.
La resina metilica fenilacetammide è una resina progettata specificamente per la sintesi peptidica in fase solida a base di Boc (Boc-SPPS). I peptidi sintetizzati su questa resina possono essere rilasciati utilizzando la scissione HF.
Nei coniugati anticorpo-farmaco (ADC), il linker collega l'anticorpo al carico utile citotossico. La scelta del carico utile è fondamentale in quanto determina l'efficacia e la specificità degli ADC nel fornire la terapia ai tessuti bersaglio attraverso specifici meccanismi di rilascio.
Il 2,2,4,6,7-pentametildiidrobenzofuran-5-solfonile (Pbf) è il gruppo protettivo guanidinico preferito utilizzato nella sintesi peptidica in fase solida basata su Fmoc (Fmoc-SPPS). Presenta una labilità acida leggermente superiore rispetto a Pmc.
La penicillamina è un analogo della L-cisteina caratterizzato dalla sostituzione di un gruppo metilico (-CH3) con un acido carbossilico (-COOH).
Autoassemblaggio dei peptidi
L'autoassemblaggio dei peptidi avviene quando i peptidi si dispongono naturalmente in strutture ordinate senza intervento esterno. questo processo è guidato da interazioni non covalenti come il legame idrogeno, le interazioni idrofobiche, le forze elettrostatiche e l'impilamento π-π. L’autoassemblaggio dei peptidi può portare alla formazione di varie nanostrutture tra cui fibre, sfere, fogli e gel, che hanno applicazioni nella scienza dei materiali, nella biotecnologia e nella medicina.
Il fenilacetile (Phenylac o Phac) è un gruppo acilico tipicamente legato all'N-terminale dei peptidi, caratterizzato da una polarità inferiore rispetto all'acetile (Ac). Costituisce una modifica permanente dei peptidi.
la fenilglicina (Phg) è un derivato aminoacidico in cui un gruppo fenile sostituisce l'atomo di idrogeno nella molecola di glicina
Peptide Istidina Isoleucina (PHI), un peptide suino correlato al VIP e alla secretina.
Peptide istidina metionina (PHM), un peptide umano correlato al VIP.
Il punto isoelettrico (pI) è definito come il livello di pH al quale la proteina/peptide ha una carica netta pari a zero (Smoluch et al., 2016).
Il 2,2,5,7,8-pentametilcromano-6-sulfonile (Pmc) è un gruppo protettivo guanidinilico comunemente utilizzato nella sintesi peptidica in fase solida basata su Fmoc (Fmoc-SPPS). È noto per essere leggermente meno acido-labile rispetto al Pbf.
La p-nitroanilina, un cromoforo, è tipicamente coniugata al C-terminale dei substrati della carbossipeptidasi. L'assorbimento della p-nitroanilina liberata viene comunemente misurato a lunghezze d'onda intorno a 405 o 410 nm.
La L-Propargilglicina (Pra) è prodotta da microrganismi. Questo amminoacido, caratterizzato dalla sua struttura a triplo legame, è altamente considerato come un'unità fondamentale per la sintesi di peptidi in grado di impegnarsi in reazioni di "chimica del clic", raccogliendo un'attenzione significativa nel settore.
L'ormone paratiroideo (PTH) è un ormone peptidico rilasciato dalle ghiandole paratiroidi, fondamentale per il mantenimento dell'omeostasi del calcio e del fosforo nel fluido extracellulare.
Le modifiche post-traduzionali (PTM) delle proteine aggiungono gruppi funzionali o proteine, tagliano subunità regolatorie o distruggono intere proteine. Questi cambiamenti, come la fosforilazione, la glicosilazione, la metilazione, l’acetilazione, la lipidazione, l’ubiquitinazione, la nitrosilazione e la proteolisi, influenzano il modo in cui le cellule funzionano normalmente e durante la malattia. Comprendere i PTM è fondamentale per la ricerca di base e la scoperta di nuovi trattamenti.
acido piroglutammico, noto anche con abbreviazioni come Pgl, Glp, pGlu o
il fenilazobenzilmetossicarbonile è un gruppo N-protettivo cromoforo utilizzato nella sintesi peptidica, scindibile mediante idrogenazione catalitica o acido forte. Presenta lunghezze d'onda di assorbimento massime a 229 nm, 320 nm e 441 nm.
Una coppia quencher è costituita da una molecola fluorescente (fluoroforo) e da una molecola quencher utilizzata nella ricerca e nei test basati sulla fluorescenza. Il quencher assorbe la luce emessa dal fluoroforo, riducendone la fluorescenza. Quando il fluoroforo e il quencher vengono separati, ad esempio attraverso una reazione biochimica, il segnale di fluorescenza aumenta. Ciò consente ai ricercatori di misurare cambiamenti e interazioni in tempo reale. Questa tecnica è comunemente utilizzata in applicazioni come PCR in tempo reale, sonde molecolari e test FRET (Förster Resonance Energy Transfer).
Il fluoro-18 è un radioligando comunemente utilizzato nell'imaging PET per valutare il metabolismo del glucosio nei tessuti ed è comunemente utilizzato nella diagnosi del cancro e nell'imaging cerebrale.
Libreria di peptidi casuali
Una libreria di peptidi casuali è una raccolta di molte brevi sequenze peptidiche generate in modo casuale. Ogni peptide nella libreria ha un numero specifico di amminoacidi con sequenze determinate casualmente, creando una gamma diversificata di molecole peptidiche. I ricercatori utilizzano queste librerie per individuare peptidi con proprietà specifiche, attività biologiche o interazioni con molecole bersaglio. Sono particolarmente utili nella scoperta di farmaci, nell'immunologia e negli studi sulle interazioni proteina-proteina, aiutando a identificare nuove terapie e a comprendere processi biologici complessi.
Un residuo è un singolo amminoacido all'interno di un peptide o di una proteina. Poiché gli amminoacidi si uniscono attraverso legami peptidici per formare queste catene, ciascuna unità di amminoacidi viene definita residuo. Questo termine viene utilizzato perché durante la formazione del legame peptidico, ogni amminoacido perde una molecola d'acqua (H2O), lasciando dietro di sé quello che viene definito residuo.
La resina è un polimero insolubile utilizzato nella sintesi peptidica in fase solida (SPPS) come supporto solido per l'aggiunta continua di aminoacidi. Le perle di resina forniscono una superficie stabile e inerte alla quale gli amminoacidi iniziali sono attaccati covalentemente, consentendo la costruzione della catena peptidica residuo per residuo.
La rodamina B è un colorante dal rosa brillante al rosso con una lunghezza d'onda di eccitazione solitamente intorno a 540-570 nm e un intervallo di luce emessa di 560-580 nm. Di solito è coniugato alla sequenza peptidica tramite il gruppo amminico N-terminale del peptide
Cromatografo liquido ad alte prestazioni a fase inversa.
I farmaci SAR (Struttura-Attività) vengono sviluppati studiando la relazione tra la struttura chimica di un farmaco e la sua attività biologica.
Sarcosina, il più semplice amminoacido N-alchilato.
La dimetilarginina simmetrica (SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (simmetrica) può essere utilizzata direttamente per la sintesi di peptidi contenenti dimetilarginina simmetrica.
La sintesi peptidica in fase solida (SPPS) è un metodo per la sintesi chimica dei peptidi, in cui i peptidi vengono assemblati gradualmente su un supporto solido o resina aggiungendo sequenzialmente amminoacidi protetti. SPPS comprende due strategie: Fmoc-SPPS e Boc-SPPS, che differiscono nella scelta dei gruppi protettivi del gruppo N-amminico (Fmoc o Boc) e dei gruppi protettivi della catena laterale. Il tipo di gruppo protettivo N-amminico selezionato determina la strategia di protezione della catena laterale e le condizioni per la scissione finale del peptide dalla resina.
La statina, abbreviata come Sta, è un amminoacido non proteico che viene spesso utilizzato nella progettazione di mimetici peptidici, in particolare nella sintesi degli inibitori della proteasi.
Il tert-butiltio (StBu) è un gruppo S-protettivo che viene scisso mediante riduzione della fosfina ed è compatibile con Boc-SPPS.
Il succinile è una modificazione polare N-terminale che corrisponde all'aspartato deaminato ed è tipicamente incorporato nei substrati della carbossipeptidasi.
TAMRA, abbreviato anche in TMR, è un fluoroforo che può essere attaccato a un gruppo amminico. Viene spesso utilizzato in combinazione con FAM per substrati FRET. TAMRA ha una lunghezza d'onda di eccitazione di 485 nm e una lunghezza d'onda di emissione di 535 nm.
Il tert-butile è un gruppo protettivo labile agli acidi comunemente utilizzato per alcoli e fenoli, che può essere scisso utilizzando acido trifluoroacetico (TFA).
Il trietilammonio fosfato è un tampone utilizzato nelle fasi mobili dell'HPLC a fase inversa.
L'acido trifluoroacetico (TFA) è stato utilizzato per la scissione del peptide dalla resina in Fmoc-SPPS e per la rimozione dei gruppi protettivi derivati da tBu.
L'acido trifluorometansolfonico (TFMSA) è un acido più forte del TFA. TFMSA può essere utilizzato come alternativa più sicura all'HF altamente tossico per la fase finale di scissione della strategia Boc-SPPS.
La L-terz-leucina (Tle) è un amminoacido non polare con catene laterali stericamente impegnative che destabilizzano le eliche.
2,4,6-Trimetossibenzile è un gruppo protettore ammidico Asn e Gln acido-labile utilizzato in Fmoc-SPPS.
Tosyl è utilizzato come gruppo protettivo per guanidina e imidazolo in Boc-SPPS e può essere rimosso da Na/NH3
Tritile (Trt) è un gruppo protettivo labile agli acidi impiegato per Asn, Cys, Gln e i suoi residui in Fmoc-SPPS. Può essere rimosso selettivamente utilizzando acido trifluoroacetico (TFA).
Polvere liofilizzata bianca
I peptidi puri esistono tipicamente allo stato di polvere bianca dopo la liofilizzazione.
Il peptide intestinale vasoattivo (VIP) è un 28-peptide di aminoacidi appartenente alla superfamiglia dei peptidi glucagone-grelina-secretina.
9-Xantidrile (Xan) è un gruppo protettivo ammidico acido-labile utilizzato per i residui Asn e Gln in Boc-SPPS. Xan può essere rimosso selettivamente utilizzando TFA.
Polvere liofilizzata gialla
Quando il peptide viene marcato con fluoresceina FAM, la polvere liofilizzata presenta tipicamente un aspetto giallo.
Lo Z-benzilossicarbonile, abbreviato in Z o Cbz, è utilizzato come gruppo protettivo amminico nella sintesi peptidica. Può essere rimosso mediante idrogenolisi o acidi forti come HF puro o HBr/acido acetico.