Confronto delle proprietà chimiche tra PNA e DNA
Il PNA (acido nucleico peptidico) e il DNA (acido desossiribonucleico) presentano differenze significative nelle proprietà chimiche, riflesse principalmente nella loro struttura molecolare, unità costitutive, basi e struttura spaziale.
Struttura molecolare e unità costituenti
Lo scheletro molecolare del DNA è collegato alternando legami desossiribosio e fosfato attraverso legami fosfodiestere. La catena principale del PNA è composta da unità ripetute di N - (2-amminoetil) - glicina collegate da legami peptidici (legami ammidici). Ciò significa che la catena principale del PNA non contiene gruppi fosfodiesteri caricati negativamente, il che rende il legame tra i filamenti di PNA e DNA più forte che tra i filamenti di DNA.
Composizione di base
Le basi del DNA sono adenina (A), timina (T), citosina (C) e guanina (G). Al contrario, la base del PNA si fonde con l'N della porzione di glicina sulla catena principale attraverso una struttura acetilica. Sebbene le sequenze di basi del PNA possano legarsi ai filamenti di DNA, le loro modalità di legame e la loro stabilità sono diverse. Le basi delle catene laterali del PNA possono formare legami idrogeno con le basi del solco principale della doppia elica dell'RNA o del DNA a doppio filamento, legandosi così all'esterno dell'RNA o del DNA a doppio filamento.
Struttura e funzione spaziale
Il DNA tipicamente esiste in una struttura a doppia elica, che è fondamentale per mantenere la stabilità e la trasmissione delle informazioni genetiche. Il PNA può formare una struttura a tripla elica, che presenta vantaggi unici in alcune applicazioni come l'editing genetico e il rilevamento degli acidi nucleici.
Combinazione di funzionalità e applicazioni
A causa dell'assenza di gruppi fosfodiesteri caricati negativamente nella catena principale del PNA, può legarsi specificamente al DNA e all'RNA a basse concentrazioni saline. Questa caratteristica rende il PNA più stabile e specifico quando utilizzato come sonda o sistema di somministrazione di farmaci. La stabilità metabolica e la forte affinità di legame del PNA lo rendono uno strumento utile per la terapia antigenica, che può inibire lo splicing o la traduzione dell'mRNA bersaglio.
Riepilogo
Nel complesso, le principali differenze nelle proprietà chimiche tra PNA e DNA risiedono nella struttura molecolare, nelle unità costitutive, nelle basi e nella struttura spaziale. Queste differenze offrono vantaggi unici al PNA in alcune applicazioni, in particolare in campi come l’editing genetico e il rilevamento degli acidi nucleici.
